Il Direttore Generale è l’organo di governo aziendale e “definisce gli obiettivi ed i programmi da attuare e verifica la rispondenza dei risultati della gestione alle direttive generali impartite”.
Il Direttore Generale dell’Azienda è titolare della rappresentanza legale ed esercita tutti i poteri di gestione della stessa adottando i provvedimenti necessari.
È responsabile delle funzioni di indirizzo, che esercita attraverso la definizione di obiettivi e programmi, dell'imparzialità e del buon andamento dell'azione amministrativa; verifica il risultato dell’attività svolta e la realizzazione di programmi e progetti in relazione agli obiettivi della gestione finanziaria, tecnica, amministrativa e sanitaria; risponde alla Regione in relazione agli obiettivi assegnatogli all’atto di nomina e nell’ambito degli atti strategici e di programmazione regionale.